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基因搜索平臺 讓DNA檢測像谷歌搜網頁一樣簡單
來源: | 作者: | 發布時間:2013-9-25 9:30:29

基因搜索平臺 讓DNA檢測像谷歌搜網頁一樣簡單


曾經幾何,人類基因組數據的檢測非常昂貴并且復雜。通常需要花費數十萬美元來進行基因組代碼的檢測,而花費如此巨大的費用得到的數據實際上僅有一部分有效數據。

  現在,這個基因代碼檢測過程將會變得簡單并且費用大大降低。創業公司OneCodex希望能夠幫助研究人員、臨床醫生等相關人員搜索這些數據。OneCodex公司的醫療人員已經對超過10萬個基因組進行排序,并且生成了PB級數據。

  同時,OneCodex公司還充當了索引參照平臺的作用。目前其仍處于開放測試階段,用戶能夠對數據庫中的數萬種細菌、病毒以及真菌數據進行搜索,以每秒鐘過濾數百萬個DNA堿基對的速度,幫助用戶在短時間內找到自己想要的數據。

  One Codex的創始人Nick Greenfield表示希望能夠將這項技術推廣到臨床傳染病領域。Greenfield介紹道:“就拿治療肺結核來說,醫生不再需要傳統的檢測方法來確定病情。只需要提取相關樣本并且對其進行排序,從而將這種樣本轉化成數據,隨后在所有病原體的數據庫中搜索相關數據。搜索結果可以顯示病人是否患有肺結核、肺結核患病的類型以及這種結核病對于抗生素是否具有抗藥性等等治療相關的數據!

  目前,One Codex公司的數據庫中有超過3萬組細菌、真菌以及病毒數據,并且這一數據還在不斷增長。六年前,人類基因組排序的費用高達1000萬美元,而現在這項費用大概只需要1200美元。雖然這一搜索平臺并不像Google搜索平臺那樣針對個人并且使用率極高,但這一平臺的出現不僅節約檢測時間而且節約了大筆費用。用一句套話說就是,利國利民。



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